本計畫內部稽核主要的目的，在於確認內部執行之落實並可經由稽核過程發現問題並適時提供改善建議，追蹤改善情況與行動，以完善本計畫之執行。本稽核依據建置臺灣生物資料庫先期規劃之延續計畫倫理實施規範、內部稽核準則。每年稽核人員依據訂定之稽核項目與頻率稽核，採用實地查核、請受稽項目經辦人員提供相關文件或資料、亦可視情況所需，諮詢或邀請專業人士協同辦理等方式辦理稽核。