將定期召開科學顧問委員會議，工作小組成員將於每次會議前，收集整理生物資料庫資訊系統的相關資料，提交委員們討論，用以制定資訊系統的各項規範。並於規劃期結束之前，制定通過「台灣生物資料庫資訊系統綠皮書」作為建置資訊系統的最高指導原則。在系統建構期間，委員會將定期監督計畫的執行進度與成果，以確保資訊系統在期限中順利完成。
委員名單如下(依委員姓氏筆畫排列)：
| 職稱 |
姓名 |
職 稱 |
隸屬單位 |
| 主席 |
龔仁文 |
所 長 |
資訊工業策進會創新應用服務研究所 |
| 委員 |
方鄒昭聰 |
教 授 |
臺北大學資訊管理研究所 |
| 委員 |
李清庭 |
院 長 |
成功大學電資學院 |
| 委員 |
李德財 |
所 長 |
中央研究院資訊科學研究所 |
| 委員 |
李錫堅 |
主 任 |
慈濟大學醫學資訊系所 |
| 委員 |
林秀芬 |
研究員 |
英國 IGER 中心 |
| 委員 |
陳珍信 |
研究員 |
中央研究院統計研究所 |
| 委員 |
莊曜宇 |
教 授 |
台灣大學電機工程學系 |
| 委員 |
楊永正 |
教 授 |
陽明大學生物資訊研究所 |
| 委員 |
劉立 |
副院長 |
台北醫學大學附設醫院 |
**本委員會由本分項主持人兼任委員會議召集人。
