單核苷酸多態性(SNP)與基因變異位點
最後更新時間:2022-04-13
小英去逛生技展,許多攤位都遞給她基因檢測和疾病風險的選單,琳瑯滿目的基因檢測項目讓小英不知所措,這些項目檢驗的根基是怎麼而來的?
我們在科普小辭典DNA一文提過「人類的DNA大約由30億個鹼基對所組成,每個人有99%的鹼基是相同的,而另外1%之不同造就每個人的差異性」,這個差異就稱為基因變異(genomic variant)。基因變異的形式有很多種,如:鹼基的取代(base substitution)、刪除突變(deletion mutation)、插入突變(insertion mutation)等。其中最常見的遺傳變異類型是單核苷酸多態性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP),屬於鹼基的取代變異,人類中大概每一千個核苷酸會出現一個SNP,也就是一個人可能會有三、四百萬個SNPs。如下圖,小英與參考序列上在DNA上的相同位點,一個是C,一個是T,這樣的差異就是所謂的SNP,但因為每個人的SNP都不盡相同,所以研究學者會運用科學方法將這些基因變異的位置找出來。
圖|小英與參考序列相同位置的基因變異位點
圖片來源|National Human Genome Research Institute (NHGRI)
基因變異不一定都會發生疾病,有些是增加發生風險,有些是保護因子,有些則沒有影響,目前科學家將已知與疾病關聯性高的基因變異位點找出來,將這個SNP當作生物標記,並加以比對分析,就可以推判受檢者是否帶有該疾病的罹患風險。
整理編輯|蕭如吟
審校|褚候維博士
【參考資料】
1.National Human Genome Research Institute (NHGRI).
2.National Library of Medicine.